Сравнение папок в Total Commander

Два каталога вместе со всеми под папками, можно сравнить по содержимому в Total   

Comander-ре. Для этого встаём с одной стороны на первой папке, а с другой — на второй. Вызываем команду Commands (Команды) / Synchronize Dirs (Синхронизировать каталоги). Ставим галки subdirs (с подкаталогами), by content (по содержимому), ignore date (игнорировать даты), не ставим галку asymmetric (асимметрично), Нажимаем кнопки разноцветные и отжимаем серую где «знак =». Далее, нажимаем справа «Compare»  (сравнить).
Результат: если папки одинаковые по содержимому файлов, то выдаст пустой список! Если нет, укажет расхождения.

Сравнение файлов в Total Commander

Выделяем оба файла, переходим Файл — Сравнение по содержимому.

Далее видим, что строки, в которых найдены отличия подсвечиваются серым цветом, а различия в них красным. Внизу общее количество найденных различий. Переход по найденным различиям осуществлять посредством кнопок Следующее отличие и Предыдущее отличие. Можно использовать поиск по тексту.
Здесь же можно сразу и перенести выбранные отличия в другой файл. Для этого необходимо активировать режим редактирования (кнопка Редактировать).